北京中醫藥學會成立于1950年5月30日。新中國成立以來，為了促進中醫藥事業的發展，黨中央、國務院對中醫藥事業十分關心和重視，制定了一系列繼承與發展中醫藥事業的方針、政策，中央領導對發展中醫藥做了很多重要指示。
北京中醫藥學會在北京市衛生局、北京市中醫管理局、北京市科學技術協會、北京社會團體辦公室的領導下，各項工作均取得了長足進展。截至2007年底，注冊個人會員總數已近5000人，團體會員單位105個。建立了組織、學術、繼續教育、中藥、咨詢、科普編輯出版6個工作委員會和學術會務部、北京中醫雜志編輯部。組建了醫院管理、醫藥管理、基礎理論、內科、婦科、兒科、男科、皮外五官科、眼科、正骨按摩、風濕病、糖尿病、腎病、脾胃病、肛腸病、急診、絡病、老年病、中藥調劑、中藥制劑、中藥藥理與中成藥、中藥化學、中藥炮制、藥事管理、中藥資源與鑒定、計算機、中醫藥教育等36個專業委員會。每年舉辦學術報告會近百場次、大型專題研討會10余次、學術交流會10～20次、高級研修班、進修班5～10期、編輯出版中醫藥期刊和學術論文集萬余冊等。
目前，北京中醫藥學會已發展成為基礎理論、臨床醫療、預防康復、教學科研、中藥研制、醫院管理、編輯出版、計算機應用、醫學科技咨詢等專家薈萃的中醫藥學術團體。能夠開展多學科、多層次、多種形式的繼續教育工作與國內外學術交流活動。
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